创新管理理念。当前，检验检疫人力不足与外经贸发展需求特别是食品安全之间的矛盾日益凸显。如何做到科学监管、高效服务，是摆在我们面前的重大课题。我们大胆探索，有效应对，确立了“以现代信息化手段，全面推动检验检疫科学管理”的工作思路。引入“合规管理”理念，从规范检验检疫内外部行为入手，降低合规风险，提高执法水平。引入“风险管理”理念，针对检验检疫所涉及的产品、工作和队伍三大风险，实施有效的风险评估、风险监控和风险防范。在做好检验检疫的同时，大力推进食品、农产品、工业品质量安全示范区建设。
创新管理方法。对内整合资源，率先研发应用中国检验检疫电子监管系统，借助信息化技术，利用电子监管控制检区内的进出口企业和产品，系统根据监管流程中的合规风险，对每批申报的出入境货物自动做出判定，无需核查的自动放行，需要核查的明确告知查验内容和检测项目，实现了对出入境货物“可快则快、该严则严”的科学监管。对外融合资源，通过与地方电子口岸合作共建信息平台，建立与企业、码头和相关执法部门信息互通机制，形成数据互联、信息共享，进一步促进了口岸物流便利化。
创新管理文化。努力实现核心价值理念，引导干部自我突破，主动将改革创新的理念转化为自觉行动。推动两岸农产品基地互认实现“零”的突破，推动台湾酒业公司首获大陆认证机构质量管理体系认证，并尝试“社会认证、官方采信”的做法，对进口产品采取较为便捷的入境监管措施。以政风行风建设为载体，以开展廉政风险防控为重点，着力培育检验检疫监督管理文化，不断提高公信力与执行力。认真开展规范公共行政权力运行和自由裁量权防控工作，并在此基础上研发运行电子监察系统，通过设置监控风险点，实时采集信息化系统中的相关数据并自动生成风险信息，把廉政监控贯穿于整个检验检疫业务流程中，从而使权力在阳光下运行。
以信息化手段创新检验检疫管理，产生了“监管有效、促进发展、规范管理”的多重效应。一是通过强化对进出口企业和产品的监管，把住了质量安全关口，提高了企业诚信意识，提升了产品质量水平，从而保证厦门检区疫情疫病截获率和产品质量合格率位居全国前列。二是通过对出入境货物从报检到放行的全程智能化监管，实现了“提速减负增效”。据统计，目前厦门口岸90%以上的出口货物和40%以上的进口货物可实现自动放行，平均每批货物可节约通关时间2小时、缩短滞港时间1.75天，每个集装箱节约物流成本200多元，每年可为企业创造效益8.12亿元。三是通过对检验检疫业务程序化控制，强化了内部管理，避免了执法随意性，提高了工作质量。厦门检验检疫局连续多年被评为“政风行风十佳单位”，整个系统荣获“全国文明单位”称号。
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